在手术困难的复发癌情况下，通常是以抗癌疗法为基础并结合实施部分放射治疗。
但是因为腹部有很多对放射线比较敏感的正常脏器（十二指肠、小肠、大肠、肝、肾脏等），所以很难照射去除肿瘤所需的足够剂量的放射线。在这种情况下，有望通过质子治疗安全地提升肿瘤控制率。

虽然目前对胃癌手术后的放射治疗的作用存在着争议，但是根据本院的大规模随机三阶段研究结果可以发现，对于伴随淋巴结转移的胃癌，手术后的抗癌化学治疗和放射治疗并用的疗法可以在去除肿瘤的同时有效提升吴冰生存率。在伴随淋巴结转移的胃癌中，在手术后采取抗癌化学治疗和放射治疗并用的疗法时，有望通过质子治疗安全地提升放射线剂量并降低急性/亚急性副作用的可能性，从而保证能够以充分的剂量实施抗癌疗法。

此外通过对质子治疗与X线治疗进行比较从而对其放射线剂量进行分析的本院研究中，已确认相对于X线治疗，质子治疗照射到几乎所有正常脏器中的放射线剂量都明显偏低。
质子治疗的实际临床应用目前还并不多见，目前只是通过几例报告确认了对于难以进行手术的胃癌患者，利用质子治疗方式能够更安全地照射高剂量的放射线，从而能够在无重大副作用的前提下去除肿瘤。